正常按票面上税额抵扣。不用担心税率差异。
本月销项-（本期进项+上期留抵），如果大于0，大于0的部分要结转本月未交增值税，也就是要交的增值税。
结转：
借：应交税费-应交增值税（转出未交增值税）
贷：应交税费-未交增值税；
交税时候
借：应交税费-未交增值税
贷：银行存款。
小于0，可以暂时不做处理。
增值税不同税率之间怎么抵扣《中华人民共和国增值税暂行条例》中，第三条的规定就是：纳税人兼营不同税率的货物或应税劳务，应当分别核算不同税率的货物或应税劳务的销售额。
未分别核算销售额的，从高适用税率。
可以用不同税率的进项税抵扣不同税率的销项。
比如用11%的运输增值税发票抵扣销售货物17%的销项发票。
当然也可以用17%的购进货物抵扣11%的运输劳务增值税发票。
总而言之，凡是税务局认证过的发票或认可的扣税凭证都可以抵扣。
增值税不同税率之间怎么抵扣可以用不同税率的进项税抵扣不同税率的销项。
比如用11%的运输增值税发票抵扣销售货物17%的销项发票。
当然也可以用17%的购进货物抵扣11%的运输劳务增值税发票。
总而言之，凡是税务局认证过的发票或认可的扣税凭证都可以抵扣，不管税率是多少。
当然得是可以抵扣的一般纳税人才行。
假如销售的税率为13%，销售100万那么销项税额为100*13%=13万，进项税率假如税率有6%的也有13%的，采购金额的进账税总额就是当期可以抵扣的进账税，假如进项税为10万，本期应纳增值税=销项-进账=13-10（8）。
扩展资料：
（1）纳税人销售或者进口货物，除以下第二项、第三项规定外，税率为13%。
（2）纳税人销售或者进口下列货物，税率为9%：粮食、食用植物油、自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品、图书、报纸、杂志、饲料、化肥、农药、农机、农膜、农业产品、以及国务院规定的其他货物。
（3）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。
（4）纳税人提供加工、修理、修配劳务税率为13%。纳税人兼营不同税率的货物或者应税劳务。
参考资料来源：百度百科-增值税税率