农产品自产自销，可以按照发票上注明的销售额的13%扣除率计算进项税额进行抵扣。
财税规定，批发、零售纳税人享受免税政策后开具的普通发票，不得作为计算抵扣进项税额的凭证。
农业生产者销售自产免税农产品(包括农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品)，开具的普通发票仍然按照13%的扣除率计算抵扣进项税额。
企业经常向农业生产者个人购进自产农产品的，可以向主管税务局申请农副产品收购发票，在购进时自行据实开具;或者，可以由农业生产者去税务局申请代开免税销售发票。
无论是企业自开的农副产品收购发票，还是税务局代开的免税农产品销售发票，均可以作为进项税额抵扣凭证。
农民专业合作社和农业企业等，销售自产的农产品时，可以开具免税的农副产品销售发票。
因此，购进企业向这类农业生产的组织和企业采购农产品，应积极索取合规的发票，以作为进项税额抵扣的凭据。
农副产品收购发票或自产自销农副产品销售发票，可以抵扣的进项税额=票面金额×9%，用于生产13%税率深加工产品按照10%扣除率计算进项税额。
法律依据《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。
进项税额计算公式：进项税额＝买价×扣除率（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
免税农产品可以抵扣进项税吗免税农产品可以抵扣进项税。
免税的农产品可抵扣进项税的方法如下：
从一般纳税人购进农产品，按照取得的增值税专用发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣；
进口农产品，按照取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额，从销项税额中抵扣；
从按照简易计税方法依照百分之三征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和百分之十一的扣除率计算进项税额；
取得农产品销售发票的，以农产品销售发票上注明的农产品买价和百分之十一的扣除率计算进项税额；
开具农产品收购发票的，以农产品收购发票上注明的农产品买价和百分之十一的扣除率计算进项税额；
农产品进项税额核定扣除，按照产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法规定，纳税人购进农产品，不再凭扣税凭证直接抵扣增值税进项税额，而是根据购进农产品所生产的商品或服务的销售情况，按照一定扣除标准，核定出当期农产品可抵扣的进项税额；
加计扣除，营业税改征增值税试点期间，纳税人购进用于生产销售或委托受托加工百分之十七税率货物的农产品维持原扣除力度不变。
免税农产品抵扣需要什么凭证亲，您好，很高兴为您解答!取得农产品免税可抵扣发票怎么做凭证?一、可抵扣进项税额的凭证(一)增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书(二)农产品收购发票或销售发票f二、不得抵扣进项税顿的凭证;(一)批发、零售环节纳税人销售免税农产品开具的免税发票1、免征蔬菜(财税〔2011)137号)2、部分免税鲜活肉蛋产品(财税(2012)75号)(二)小规模纳税人开具的增值税普通发票三、各类抵扣凭证进项税额计算(一)农产品收购发票或者销售发票1、一般情况取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
可加计扣除时纳税人购进用于生产销售或委托受托加工13%税率贷物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额，领用时进行增值税加计扣除。
未分别核算时纳税人购进农产品既用于生产销售或委托受托加工13%税率货物又用于生产销售其他货物服务的，应当分别核算用于生产销售成委托受托加工13%税串货物和其他货物服务的农产品进项税额。
未分别核算的，统一以农产品收胸发票或销当发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
(二)增值税专用发票海关进口增值税专用缴款书1、从一般纳税人处购入国文采东海听芹00取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴费书上注明的增值税额为进项税额。