公司申请注销一般不会出现自身风险提示，但是最大的风险可能来自在注销前的税务的一些清税证明。
目前的话公司申请注销，可能大致流程就是首先股东先形成一个股东决议，同时对于一些债权债务会有相关的约定，然后可能就是向税务去发起税务的注销，那税务注销之后可能进行一些核查，如果没什么问题，税务那边会出一个清税证明，拿了清税证明同时就可以去工商办理注销了，工商注销的话很有可能会问你有一些债权债务的关系啊，还有一些股权等事情，同时也会要求法人签字等等一系列的手续。
在这过程中其实最主要的是两方面的风险吧，一个是税务上的风险，就是税务可能对于企业的一些资产啊，或者还有一些未处理的往来，等会提出异议，有的时候可能会进行查账，这时候一查可能往往就会出现大问题。包括企业一些没有组织到的存货，还有一些没法支付的往来等等，有的时候会让企业调整缴税。
在税务端的事情解决之后，企业可能面临的最大的就是债权债务，包括通知相关的债权人需要企业要履行债务嘛，然后就是到公司去注销了，因为可能即使有的时候公司注销了，如果当时的债权人有理由相信是公司注销是存在问题的，他还是可以向当时的股东去追责的。
所以一般申请注销时不会出现自身风险提示，每年最多的风险提示也就是工商会跳出来没有按时完成工商年检等一些的工商异常等情况。
税务注销后还有税务风险吗税务注销后还会有税务风险的。
主要看具体情况定，公司注销后，税务对你公司有疑点或有人密告你公司以前偷税漏税，在证据确凿的情况下，除非账簿原始销毁期限满期，否则，税务局肯定还会追查的。
法律分析1、医疗费：医疗费根据医疗机构出具的医药费、住院费等收款凭证，结合病历和诊断证明等相关证据确定。
误工费：误工费根据受害人的误工时间和收入状况确定。
护理费：护理费根据护理人员的收入状况和护理人数、护理期限确定。
交通费：交通费根据受害人及其必要的陪护人员因就医或者转院治疗实际发生的费用计算。
住院伙食补助费：住院伙食补助费可以参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准予以确定。
营养费：营养费根据受害人伤残情况参照医疗机构的意见确定。
残疾赔偿金：残疾赔偿金根据受害人丧失劳动能力程度或者伤残等级，按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，自定残之日起按二十年计算。
但六十周岁以上的，年龄每增加一岁减少一年;七十五周岁以上的，按五年计算。
法律依据《中华人民共和国税收征收管理法》 第十六条 从事生产、经营的纳税人，税务登记内容发生变化的，自工商行政管理机关办理变更登记之日起三十日内或者在向工商行政管理机关申请办理注销登记之前，持有关证件向税务机关申报办理变更或者注销税务登记。
公司注销5大税务问题,一定要解决好!当前，很多公司经营不下去会选择进行公司注销。而就公司注销来讲，公司在注销前会经过一系列的审核。这就导致许多老板产生这样一个认识误区：认为公司只要注销了，即便后面被发现税务相关问题也与自己无关了。事实上，这一观点是错误的。
因此，公司要想不被查，先得会自查，在办理公司注销前，这些容易“爆雷”的坑一定要妥善处理。具体包括以下情形：
账面有存货，但无实物
已经销售的货物不做账、不开发票，隐瞒销售收入，同时销售成本不结转，导致账面存货数大于实际库存数。
处理办法：需立即进行自查，并补缴增值税、企业所得税等税款。
存货损毁需查明原因，如果有充分证据证明属于合理损耗，那么增值税无需处理，损失也可以在企业所得税前扣除。
账面有存货，但已过期
该情况有两种处理方式：
作为资产损失处理；
低价销售。
增值税有留抵不能退，开票给关联方了
在此需要提醒注意的是：与关联公司之间的交易必须有合理的商业目的，且价格公允，否则，可能会被认定为虚开发票！
老板从公司借款未归还
企业注销前一定要好好自查一下“其他应收款”等往来科目。
印花税未足额缴纳
印花税的征税范围非常广泛，购销、租赁、注资、营业账簿等都涉及印花税。
而这平时不起眼的小税种在注销的时候通常会被税务局翻个底朝天。
此外，如今随着金税四期到来，预警系统会更为严密，公司正常经营期间一定要：如实申报、四流合一。否则，一旦税务存在问题，即便是公司注销了，也会依法追究公司责任。
公司注销常见税务问题1、非正常户如何注销？
被纳入了非正常户的企业，还需要先补充纳税申报、补缴税款并缴纳相应的滞纳金和罚款，解除非正常状态后，才能按照正常程序提交注销申请。
注销时税务要查三年的账吗？
目前税收法规并没有明确规定公司注销时必须查账，要视企业的具体情况而定。之所以有查三年账的说法，是因为《税收征管法》第五十二条对税款追缴期有规定：“因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金。”再次提醒大家：不要以为注销完就没事了，如果有偷税漏税等违法行为，税务机关可以无限期追责。
公司注销与吊销有何区别?
该怎么处理非正常注销?
一般纳税人企业如何进行注销?企业注销流程是怎样的?