南京建筑企业资质办理流程如下：1、建筑业企业领取工商营业执照；2、申请企业按照属地管理的原则向所在区县建筑业管理部门提交资质申请材料原件及复印件，区县建筑业管理部门初审合格后报市建管处施工科；3、施工科对资质申请材料进行审核、公示；4、公示完成后，无异议的予以核准、报省建管局备案、打印资质证书；5、施工科对资质申请材料进行审核、公示；6、公示完成后，无异议的予以核准、报省建管局备案、打印资质证书。
法律依据：《建筑业企业资质管理规定》第七条工程施工总承包企业资质等级分为一、二级；施工承包企业资质等级分为一、二、三、四级。
工程施工总承包企业和施工承包企业的资质等级标准及承包工程范围由国务院建设行政主管部门统一组织制定、发布；专项分包企业的管理办法由省、自治区、直辖市人民政府建设行政主管部门制定。
第八条工程施工总承包企业和施工承包企业的资质实行分级审批。
一级企业由国务院建设行政主管部门审批；二级以下企业，属于地方的，由省、自治区、直辖市人民政府建设行政主管部门审批。
直属于国务院有关部门的，由有关部门审批。
第九条已经设立的建筑业企业申请资质，应向资质管理部门提供下列资料：（一）建筑业企业资质申请表；（二）企业法人营业执照；（三）企业章程；（四）企业法定代表人和企业技术、财务、经营负责人的任职文件、职称证件；（五）企业所有工程技术、经济人员的职称证件，及关键岗位从业人员职业资格证书。
（六）企业的生产统计和财务决算年报表；（七）企业的验资证明；（八）企业完成的代表工程及质量、安全评定资料；（九）其他需要出具的有关证件。
工程施工总承包企业进行工程勘察和设计业务时，还需出具有关部门颁发的《工程勘察资格证书》和《工程设计资格证书》。
怎样办理建筑资质证办理建筑资质证的步骤如下：一、准备营业执照，申请资质前，建筑企业须先注册好公司，领到营业执照，登录建委网站，注册企业用户。二、填写信息，收集材料，整理卷宗，按照资质的等级的标准，准备好所有的相应的技术人员的资料，比如一级建造师、二级建造师、高级工程师、工程师、九大员、技术工人等。人员资料一般包括：1.技术负责人的身份的证明、职称的证书或是技能的证书以及执业的资格证书;2.技术工人的身份的证明、职业的技能的证书或职业培训的合格证书;3.中级及以上职称人员的身份证明、职称证书;4.现场管理人员的身份的证明、岗位额证书;5.主要人员申报前3个月的社保的证明。三、递交资质申请，网上材料齐全并全部打印出来之后，企业要以法人的名义向区县的建设行政主管部门提出书面申请，区县建设行政主管部门同意后，上报市住房和城乡建设局。四、接受现场核查，市住房和城乡建设局要对申请资质的企业进行一些相关的审核，而审核的内容主要审核企业的人员、企业的资产和工程的业绩是否符合资质标准，符合资质条件后才会下发批准文件。五、上报市建管处，企业应按照归属地的管理原则向所在地区内的建筑业管理部门去进行提交有关资质申请材料原件以及材料的复印件，而区建筑业管理部门经初审合格后再上报市建管处。六、进行公示，市建管处对资质的申请材料进行审后核，会对属于市级核准范围的资质进行公示，公示之后无异议的予以核准并报向省建管局进行备案并等待领取证书;对那些属于省级核准范围内的资质，要将资质申请材料上报给省建管局，并且在资质核准后等待领取证书。七、领取证书，企业在资质经过核准后，应到市住建局的工程科去进行办理建造师注册的手续，待领取完注册建造师证书只之后，再去领取资质证书。
办理建筑资质流程建筑资质办理流程
第一步，准备营业执照：申请资质前，建筑企业必须有营业执照。
第二步，根据申请的资质标准配备专业人员，同时要考取相应的证件：准备申请资质等级相应的技术人员资料一级建造师、二级建造师、高级工程师、工程师、九大员、技术工人等。
第三步，提出申请：办理资质的企业要以法人名义向企业注册所在地的区县建设行政主管部门提出书面申请，区县建设行政主管部门同意后，上报地、州、市建设局，地、州、市建设行政部门审查合格并签署意见，报厅建筑管理处。
第四步，审核批准：市住房和城乡建设局对申请资质的企业进行审核，主要审核企业人员、企业资产、工程业绩是否符合资质标准。
第五步，上报：申请资质的企业按照属地管理的原则向所在区建筑业管理部门提交资质申请材料原件及复印件，区建筑业管理部门初审合格后报市建管处。
第六步，公示：建管处对资质申请材料进行审核，对属于市级核准范围的资质进行公示，公示完成后，无异议的予以核准并报省建管局备案。
第七步，领证：企业在资质核准后，到市住建局工程科办理建造师注册手续，待领取注册建造师证书后，再领取资质证书。
具体如下图：
资质办理流程图