如果分别核算用于生产销售13%的税率货物和其他货物服务的农产品进项税额的，按照增值税专用发票上注明的金额×9%来抵扣，9%全额填写在第6栏“农产品收购发票或者销售发票”，计入第4栏。
如果没有分别核算用于生产销售13%的税率货物和其他货物服务的农产品进项税额的，按照统一增值税专用发票上注明的增值税额为进项税额，即按照增值税专用发票上注明的金额×3%来抵扣，填写在2或3栏，计入第1栏。
农产品核定扣除申请怎么写？如果您的农产品收入需要进行核定扣除申请，可以按照以下步骤进行申请：
根据当地农业管理规定，收集必要的材料，并了解申请的标准，包括前期农作物种植的成本、投入和实际收成情况等。
编写核定扣除申请书，需注明本次申请的类型和申请的理由，包括对农产品的分类、生产地点、成本核算计算方式等详细说明，并附上必要的证明文件。
根据要求填写好该申请表，并加盖公司公章和数据证明。
如果需要的话，您还需要到相关地方办理相应的手续，并向当地农产品管理机构递交相关的申请材料。
等待农业管理机构的核定结果。
如果需要申请农产品核定扣除，建议您先了解当地的具体政策，以免遗漏关键的材料或资料。同时，需要明确各项政策和相关规定，只有合规申请才能被农业管理机构批准和认可。
农产品核定扣除增值税进项税额计算表怎么填说明:
本表“产品名称”栏分别填写不同扣除标准的产品名称。
本表“当期准予抵扣的农产品进项税额”栏11=1×2×3；11=4×5；11=6×7×8；11=9×10。