需要填报的报表均在营改增的税控系统内，上传申报，没有网络的需要保存至报税盘到税务局申报
在国税购买税控系统（包括税控软件、税控盘、报税盘）
其实和以前差别不大仅仅是把营业税改为增值税，其他都没有任何变化，城建、教育费附加、地方教育费附加、印花税、个人所得税还都是在地税缴纳申报，只是营业税改在国税申报。
公司网上报税的流程是怎么报的？企业报税的流程如下：一、在自己的开票系统中点报税处理，报完税；二、是进入国税网填好纳税申报表一中的开出票的份数和实际销售金额和实际销售税额 ，再保存；三、退出在申报页面上点自动生成就可以了。
货物运输代理免征增值税怎么申报国际货物运输代理服务免税管理，按照《青岛市国家税务局关于营业税改征增值税试点增值税减免税管理若干问题的通知》(青国税函2014年第10号)文件执行，并满足下列要求。
(一)备案资料
纳税人减免税申请，内容主要包括：企业基本情况(企业名称、经营范围、注册资金等);代理业务情况(经营方式、境内境外业务、费用结算等)。
《纳税人减免税申请审批表》
商务部门的国际货代企业备案证明材料。或者交通运输主管部门批准核发的《无船承运业务经营资格登记证》、《国际船舶代理经营资格登记证》、《外商独资船务公司经营许可证书》(核查原件留存复印件)。
与委托人、其他代理人签订的国际货运代理合同或协议、确认书等其他的形式合同;合同较多的以合同清单汇总表(表样见附件1)形式提供(核查合同原件留存复印件)。
与委托人、其他代理人通过金融机构结算证明(核查原件留存复印件)。
(二)备案程序
自2014年9月1日起，符合《公告》免税规定的纳税人应到主管税务机关办理备案，方可在次月办理免税申报。
符合《公告》免税规定，办理备案纳税人的备案期限为2014年9月1日起。
为统一免税备案资料，原已按《财税﹝2013﹞106号文件》规定办理国际货物运输代理免税备案的纳税人，需自2014年9月1日起重新办理备案。
管理要求
(一)免税期限
自2014年9月1日起，纳税人提供国际货物运输代理服务，符合《财税﹝2013﹞106号文件》和《公告》免税规定的均可享受增值税免税政策。2014年9月1日前发生的国际货物运输代理业务仍按原政策规定执行。
(二)资金结算
《财税﹝2013﹞106号文件》和《公告》规定的“金融机构结算”应通过对公帐户结算。包括：①向委托人收取的全部代理服务收入，②向其他代理人支付的与国际货物运输代理服务免税业务有关的全部费用。个人银行卡结算和现金支付不得享受免税。
(三)应税免税划分
适用免税政策的纳税人，不得针对不同委托人、或同一笔提(运)单下的不同业务分别适用免税、应税政策。
提供国际货物运输代理服务的纳税人，可以放弃免税。纳税人放弃免税权，其全部增值税应税货物或劳务以及应税服务均应按照适用税率征税，并且36个月内不得申请免税。
对既提供国际货物运输代理服务，又提供国内仓储(包括堆场)、装卸搬运、代理报关等服务的纳税人，如同时符合以下三个条件，可以按应税和免税分别申报，分别开具增值税专用发票和普通发票，否则，应就全部服务收入按适用税率申报纳税。
(1)与委托人、其他代理人应分别签订国际货物运输代理和其他应税业务代理合同;
(2)国际货物运输代理和其他应税业务代理收入应分别进行核算;
(3)从事货物运输代理服务的试点纳税人，取得的进项税额中属于国际货物运输代理免税项目对应的进项税额部分，应作进项税额转出处理。对无法单独划分免税、应税项目的进项税额，应按当期销售额比例进行分摊。
(四)发票开具
享受国际货物运输代理服务免税的纳税人，不得开具增值税专用发票，可开具普通发票。如放弃免税，纳税人可开具增值税专用发票。
(五)后续管理
享受国际运输代理企业免税的纳税人，每月应将发生的免税业务按《国际货物运输代理企业申请免征增值税业务明细表》(见附件2)的要求逐笔填写并与申报的免税销售额一致。
纳税人应按月留存《国际货物运输代理企业申请免征增值税业务明细表》，涉及相关的纸质资料应妥善保管，税务机关应不定期进行检查。如发现问题，按有关规定处理。
附件：
《国际货物运输代理企业申请免税合同清单汇总表》
《国际货物运输代理企业申请免征增值税业务明细表》