是按9%抵扣，生产的话可以加扣1%。
农产品加计扣除1%计算是在生产环节，会计分录：可以抵扣的进项税额=原材料成本*1%。
购进农产品进项税的扣除规定是： 1、一般纳税人开具的增值税专用发票，购进企业可以按规定进行抵扣，即可以按照票面注明的税额抵扣； 2、海关进口增值税专用缴款书。
企业购进进口原辅材料的，可以按海关进口增值税专用缴款书注明的税额进行抵扣； 3、向农业生产者购进的自产农产品，可以凭农副产品收购发票或自产农副产品销售发票抵扣进项税额。
可以开具农产品免税发票有什么情形 1、农业生产者销售的自产农产品； 2、农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品； 3、采取“公司+农户”经营模式销售畜禽； 4、制种企业在定点生产经营模式下生产销售种子； 5、对从事蔬菜批发、零售的纳税人销售的蔬菜； 6、从事农产品批发、零售的纳税人销售的部分鲜活肉蛋产品。
增值税的征收范围有哪些？ 1、营业税改增值税主要涉及的范围是交通运输业以及部分现代服务业； 2、交通运输业包括：陆路运输、水路运输、航空运输、管道运输； 3、现代服务业包括：研发和技术服务、信息技术服务、文化创意服务、物流辅助服务、有形动产租赁服务、鉴证咨询服务。
综上所述是小编对购买农产品的增值税怎么抵扣做出的相关回答，希望可以帮助到您 【法律依据】： 《中华人民共和国增值税暂行条例》 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣： （一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。
进项税额计算公式： 进项税额＝买价×扣除率 （四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
农产品进项税额计算扣除的方法增值税一般纳税人从农业生产者购进免税农产品可以凭取得的农产品销售发票或开具的收购发票上注明的买价乘以扣除率计算进项税额抵扣增值税。
增值税一般纳税人购进农产品可以根据供应商身份以及取得发票的类型可以分为以下4种情况: 1、取得一般纳税人开具的增值税专用发票 供应商为一般纳税人，且对方开具了增值税专用发票，按照发票上注明的税额抵扣增值税，取得增值税专用发票，勾选认证抵扣即可，无需额外计算准予抵扣的进项税额。 2、取得小规模纳税人开具的增值税专用发票 从小规模纳税人处采购农产品，取得小规模纳税人开具的3%的增值税专用发票，不要勾选认证抵扣，准予抵扣的进项税额需要计算。 进项税额=发票上注明的金额×扣除率 纳税人购进农产品生产初级农副产品或直接对外销售的，扣除率为9%;纳税人购进农产品用于深加工生产或委托加工13%税率的货物，扣除率加计1%，即扣除率为10%。 一般纳税人从小规模纳税人处采购农产品，取得免税普通发票的，进项税额不得抵扣，比如从从事蔬菜批发、零售的纳税人处购进蔬菜取得对方开具的免税普通发票，不得计算抵扣进项税额。 3、向农业生产者或农民专业合作社购进自产农产品 一般纳税人向农业生产者或农民专业合作社购进其自产的农产品，可以凭借对方到税局代开的免税农产品销售发票或纳税人自行开具的农产品收购发票计算抵扣进项税额。 进项税额=买价×扣除率 买价是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。 扣除率依然根据纳税人购进农产品后生产销售的产品适用税率确定，生产适用9%税率的初级农副产品，则扣除率为9%，生产适用13%税率的应税商品的，扣除率为10%。 4、纳税人购进进口农产品 一般纳税人直接购进农产品，凭取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的税额抵扣增值，无需计算进项税额。 一般纳税人企业职工食堂购进农产品用于职工福利，进项税额不得抵扣。根据《财政部、国家税务总局 关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税2016年36号)第二十七条规定，用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产和不动产，进项税额不得从销项税额中扣除。
餐饮业购进农产品如何抵扣法律分析：享受免税政策，没交增值税，当然是没法给开具专票的，所以购买方这种情况没法抵扣，但是农产品不一样，购进农业生产者自产农产品的免税发票却可以抵扣。农产品进项税额的抵扣政策分为两大体系，一是凭票扣除体系，一是核定扣除体系，两者是非此即彼的互斥关系，也就是说，如果某一纳税人纳入了核定扣除体系，就不得再凭票扣除。其次，凭票扣除，购进、进口商品取得专票、海关专用缴款书抵扣进项税，销售方销售这些商品肯定是按规缴纳了增值税的。正常情况下，销售方缴纳多少增值税，就能抵扣多少。
法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》第十五条 下列项目免征增值税：
（一）农业生产者销售的自产农产品；
（二）避孕药品和用具；
（三）古旧图书；
（四）直接用于科学研究、科学试验和教学的进口仪器、设备；
（五）外国政府、国际组织无偿援助的进口物资和设备；
（六）由残疾人的组织直接进口供残疾人专用的物品；
（七）销售的自己使用过的物品。
除前款规定外，增值税的免税、减税项目由国务院规定。任何地区、部门均不得规定免税、减税项目。