纳税人购进货物或销售货物以及生产经营过程中支付的运输费用，可以凭取得的合规抵扣凭证抵扣进项税额。 进项税额是指纳税人购进货物、应税劳务、服务、无形资产及不动产支付或实际负担的增值税税额，纳税人购进运输服务，取得合规抵扣凭证(增值税专用发票)，可以凭票面上的税额抵扣增值税。
实务中，纳税人购进运输服务，主要分为以下几种情况，企业购进原材料等过程中，由于采购方不负责运输费用，而由本企业实际承担的运输费用(第三方运输公司将运输发票开给本企业);企业对外销售货物，与第三方运输企业签订送货到门的运输费用;生产经营过程中，比如半成品、产成品等不同仓库之间运输，与第三方运输企业签订的运输服务协议;本企业员工出差期间购进的国内旅客运输服务。 与第三方运输公司签订货物运输服务协议，凭取得的增值税专用发票，抵扣增值税，运输服务适用税率为9%，若第三方运输企业为小规模纳税人，适用3%征收率。
需要注意以下情况的运输费用不得抵扣增值税进项税额:1购进运输服务用于免税项目、简易计税项目、集体福利以及个人消费的;2非正常损失的购进货物对应的交通运输服务;3非正产损失的在产品、产成品对应的运输服务，4非正常损失的不动产、在建工程所耗用的运输服务;5国务院财政、税务主管部门规定的纳税人自用消费品对应的运输费用。 对于企业购进国内旅客运输服务，增值税抵扣凭证包括增值税专用发票，增值税电子普通发票，注明旅客身份信息的航空电子客票行程单、注明旅客身份信息的铁路车票、注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票。
增值税专用发票和增值税电子普通发票凭发票上的税额抵扣增值税，取得注明 旅客身份信息的航空电子客票行程单、铁路车票、公路、水路等其他客票需要计算可以抵扣的进项税额。 航空旅客运输进项税额=(票价+燃油费)÷(1+9%)×9% 铁路旅客运输进项税额=票面金额÷(1+9%)×9% 公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷(1+3%)×3%
运费可以抵扣进项税吗运费可以抵扣进项税。
增值税一般纳税人购买货物和销售产品产生的运输费用，可以根据运费结算单据（普通发票）所列运费金额按7%的扣除率计算进项税额，记入增值税，进项税科目，可以抵扣销项税，但随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费不得计算进项税额。
可以抵扣进项税的情形具体如下：1、从销售方取得的增值税用发票上注明的增值税额；2、从海关取得的属海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额；3、购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。
综上所述，运费可以抵扣进项税，但是需要注明身份。
【法律依据】：《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条纳税人购进货物或者接受应税劳务（以下简称购进货物或者应税劳务）支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。
进项税额计算公式：进项税额=买价*扣除率（四）购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算的进项税额。
进项税额计算公式：进项税额=运输费用金额*扣除率准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
运费的增值税如何抵扣小规模企业支付的运费的增值税不能进行抵扣，对于一般纳税人而言，企业购进商品或者材料等所支付的运费，可以根据对方开具的增值税发票上的税额进行勾选认证后抵扣，其抵扣方式和其他增值税专用发票一致，分录为
借：原材料—XX材料—运费
应交税费—应交增值税—进项税额
贷：应付账款等。