甲方要求开发票，这很正常。按照甲方要求去办即可。
通常情况下，企事业单位的支出业务，多数“见票付款”。以企业为例，企业向施工方支付工程款，往往需要施工方提供与该工程相关的发票，因为企业支出业务，多以发票为凭据进行会计核算，有发票的支出才能税前扣除。据此，甲方要求开发票，合情合理。
作为施工方，做工程开发票，意味着需要纳税。如本题，施工工程开发票，需要计缴增值税、附加费及个人所得税等税费。尤其是个人所得税，按劳务报酬或经营所得计税，税额可能相差甚远。由于题目对“工程”类型及相关的金额描述不详细，恕我也不予测算。
缴纳必要的税费，必定会抵减工程收入，为此，可能要重新考虑工程报价问题。重要的是，一定要在合同或协议中明确约定相关工程款及税费。尤其是对于税费承担约定不明，工程结算时相互扯皮时有发生（相关的税费计算，自己不懂，甲方应该也有人会算吧）。
主要开发票，税费的问题，其他就没有什么特别的了，闪了。祝好运！